Ich hab es gefunden.
Eine Ausnahme davon ist tunnel=[building_passage]
(https://wiki.openstreetmap.org/wiki/DE:Tag:tunnel%3Dbuilding_passage), die keinen Layer-Tag erhält.
Ursache ist vermutlich, dass ID bei Schnitt von Gebäude mit Straße fragt: “darüber oder darunter” und dann einfach den Layer setzt anstatt eine Passage vorzuschlagen. Die -1 stand nämlich auch noch an den Straßenstücken vor und hinter der Passage.