Qué raro. No suelo usar el editor en línea, en este foro hay gente con más experiencia que yo con el editor iD, pero me suena raro que al copiar y pegar una geometría no genere una geometría idéntica. He probado a seleccionar una geometría cualquiera, copiarla (Ctrl+C) y pegarla (Ctrl+V) y, en mi caso, me genera una geometría idéntica.